截至2022年2月,北京开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台助力客户发表文章影响因子累计突破1000分!是目前国内利用 10x 平台支持客户发文最多、累计影响因子最高的公司。
“千”里之行,始于足下
所谓“千”里之行,始于足下,开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台正是一步一步,脚踏实地,不断完善自身,为客户提供更为优质的服务。在2015年率先引进 10x Genomics 高通量单细胞检测平台,2018年支持发表了国内第一篇 10x Genomics 单细胞测序文章,2019年同时获得了单细胞转录组、单细胞 ATAC 和单细胞免疫组库3个服务产品的官方 CSP 认证,2020年获得了空间转录组产品的官方 CSP 认证,成为目前国内唯一一家同时获得4项10x Genomics 平台服务官方认证的公司。2021年支持发表了国内第一篇空间组学高分文章,同年引入 Chromium X 平台,开启百万级高通量单细胞技术新时代。逐步建立了包括单细胞转录组、单细胞免疫组库、单细胞 ATAC、单细胞蛋白、单细胞核 ATAC 与转录组联合、空间转录组、空间蛋白等完善的单细胞和空间测序解决方案。现已完成超过10000例样本,150余种的样品类型的服务,累计支持客户发表文章71篇,影响因子超过1000分。文章覆盖Nature 、Cell、Cancer Discovery、Circulation、Nature Cell Biology 等期刊。
厉害了!各位科研合作老师!下面由小编为大家分享部分发表文章
开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台支持客户发表文章揭示成纤维细胞调控自身免疫疾病发生的机制
皮肤作为物理屏障和免疫界面,保护身体免受外部环境的影响。免疫细胞的异常激活可诱发常见的皮肤自身免疫性疾病,如白癜风,其特点是身体某些解剖区域的双侧对称性病变。了解皮肤免疫细胞的活动如何调节对于自身免疫性疾病的治疗是必要的。本研究通过使用一种基于自体活化的 CD8+ T 细胞(靶向表皮黑素细胞)的白癜风小鼠模型,确定了真皮成纤维细胞亚群是驱动自身免疫活动关键细胞类型。结合白癜风患者皮肤样本的单细胞转录组测序、细胞类型特异性基因敲除和植入实验,发现在白癜风患者皮肤中的多种 IFN-γ 反应细胞类型中,只有真皮成纤维细胞可以通过分泌趋化因子来招募和激活 CD8+ 细胞毒性 T 细胞。人体不同解剖部位的真皮成纤维细胞在对 IFNγ 的反应不同,存在趋化因子的差异性表达。在白癜风小鼠模型中,不同部位成纤维细胞的 IFN-γ 抗性可以决定皮肤色素脱失的模式。本研究确定了不同解剖部位的成纤维细胞对 IFN-γ 的响应存在差异,而这种差异正是产生白癜风病变特征的关键决定因素,并强调了间充质细胞亚群是治疗自身免疫性疾病的治疗靶点。
开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台支持客户发表文章发现 MET 扩增通过抑制 STING 减弱肺肿瘤对免疫治疗的反应
免疫检查点疗法(ICB)已在 NSCLC 患者中表现出一定的治疗效果,在总生存期、持久反应和良好的安全性方面均有显著益处。尽管 ICB 已经造福于部分癌症患者,但由于原发性或继发性耐药的,大多数患者最终未能对 ICB 治疗产生反应。本研究通过81名非小细胞肺癌(NSCLC)患者免疫检查治疗(ICB)前后比较发现 MET 扩增的患者对 ICB 耐药,利用单细胞转录组测序发现肝细胞生长因子受体(MET)扩增通过 UPF1 蛋白降低了 STING 的表达,弱化了 IFN 反应,影响了抗肿瘤免疫的产生。而 MET 抑制剂与抗 PD-1 抑制剂联合使用,能增强抗肿瘤免疫,有助于肿瘤消退。本研究首次表明 MET 拷贝数是影响肺癌患者对 ICB 反应的一个关键因素,并有希望快速转化到临床应用中。
开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台支持发表国内第一篇空间组学高分文章
作为血液源头的造血干细胞,具有自我更新和多向分化的能力,不仅能够维持机体的终身造血,也是恶性血液疾病移植治疗的重要细胞来源。但是,造血干细胞来源不足却是限制其推广的瓶颈。如何扩增足够数量的功能性造血干细胞,一直是基础科学研究的难点和热点之一。在脊椎动物胚胎发育过程中,胎肝是造血干细胞扩增的天然场所。在这里造血干细胞进行快速的扩增,并能保持较强的干性。全面、系统、立体化地解析这一扩增性造血器官,将为体外扩增造血干细胞提供理论指导。该研究利用单细胞转录组和空间转录组联合分析的方法,绘制了小鼠胎肝发育的单细胞时空转录组图谱,解析了造血干/祖细胞的转录组和功能异质性,鉴定了造血干细胞扩增的功能单元(HSC ‘pocket-like’ units, HSC PLUS)并揭示其分子机制。
开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台支持客户发表文章研究下丘脑神经元多样性起源
下丘脑,作为一个对生命维持至关重要而且高度复杂的脑区,其发育过程中复杂的细胞谱系演化,以及神经元多样性的起源仍是一个远未解决的难题。本研究利用单细胞转录组测序结合谱系追踪对胚胎11天(E11)、14天(E14)及产后0天(P0)、7天(P7)共4个时期的43,261个发育中的下丘脑特异性标记工具小鼠下丘脑细胞进行了分析,共鉴定出8大群神经细胞。成功描绘出 RGCs、IPCs、新生神经元和肽能神经元在下丘脑神经谱系中的发育轨迹,鉴定出关键细胞类群的分子特征和发育潜能,并最终阐明了下丘脑神经元的复杂性来源,揭示了新规律,拓展了下丘脑发育的研究边界。
开云(中国)Kaiyun单细胞空间平台支持客户发表文章揭示主动脉瘤组织修复机制
除了维持免疫耐受外,Foxp3+ 调节性 T 细胞 (Tregs) 在组织稳态和重塑中发挥特殊作用。然而,动脉瘤中的 Tregs 是否具有组织特异性的表型和功能尚不清楚。本研究中发现了一组特殊的可能抑制腹主动脉瘤(AAA)进展的 Tregs,并对其进行了功能表征。主动脉 Tregs 在 AAA 进展中逐渐增加,主要来自外周循环。单细胞 TCR 测序和批量 RNA 测序显示了它们独特的表型和高表达 Tff1。利用 Foxp3cre/creTff1flox/flox小鼠研究 AAA 中 Tff1 的作用,发现主动脉 Tregs 分泌 Tff1 以调节平滑肌细胞 (SMC) 的存活。体外实验证实 Tff1 通过细胞外信号调节激酶(ERK)1/2途径抑制平滑肌细胞凋亡。这些发现揭示了主动脉 Tregs 的组织特异性表型和功能,并可能为预防 AAA 提供一种有希望的新方法。
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开云(中国)Kaiyun科研服务拥有一支高素质、经验丰富的专业技术团队,一直以顾客为中心,以坚持科技领先,服务完善,注重细节,质量稳定为基本点,提供创新、完善的整体解决方案。在20年的科研服务过程中,一贯秉承高质量的专业技术服务精神,自主开发和引进了一系列先进的高通量筛选和验证平台,为国内外众多的科研院所提供科研服务,支持国内外科研机构及企事业单位发表 SCI 论文2100余篇,杂志总影响因子超过10200分,其中20分以上文章50篇,10分-20分文章140篇。文章领域涉及基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、微生物组、系统生物学等多个技术领域。